Congresos NNB-UNAM, Semana Nacional de Bioinformática NNB-2010

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ANÁLISIS TRANSCRIPCIONAL DEL FACTOR TRANSCRIPCIONAL ABA INSENSITIVE 4 (ABI4) DURANTE LA EMBRIOGÉNESIS DE Arabidopsis thaliana Y DE SU POSIBLE ORTÓLOGO EN Theobroma cacao.
alma fabiola hernández bernal

Última modificación: 2010-07-26

Resumen (trabajo de investigación actual y motivos para asistir)


Estudios relacionados al proceso de embriogénesis en plantas, utilizando como modelo experimental a Arabidopsis thaliana, han demostrado que existen genes que regulan tal proceso, muchos de éstos codifican para factores de transcripción tipo LEC, también conocidos como genes maestros. En cuanto al gen ABI4, perteneciente a la familia AP2, se sabe que participa en varios procesos durante la germinación y establecimiento de la planta. Sin embargo, se ha encontrado que también se expresa durante el proceso de embriogénesis. Uno de los objetivos de este trabajo es conocer la regulación y la posible interacción de ABI4, con algunos de los genes maestros durante la embriogénesis de A.thaliana. Adicionalmente, se está tratando de buscar el posible ortólogo de ABI4 en la plata Theobroma cacao. De manera que, con este proyecto se pretende contribuir para sentar las bases moleculares de ABI4 tanto en una semilla ortodoxa como es el caso de A. thaliana, como en una semilla recalcitrante como lo es T. cacao.

Para mi seria de gran ayuda poder asistir al taller, porque me enseñaría a emplear muchas de las herramientas que brinda la bioinformatica, y que estoy segura me servirán para poder emplearlas en mi proyecto, debido a que yo estoy en la búsqueda de encontrar al posible ortólogo de ABI4 en la planta T. cacao, pero para esto, debo llevar a cabo análisis bioinformaticos detallados.


Citas


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Bossi, F., Cordoba, E., Dupré, P.,  Santos-Mendoza, M., San Román, C., León, P. 2009. The Arabidopsis ABA-INSENSITIVE (ABI) 4 factor acts as a central transcription activator of the expression of its own gene, and for the induction of ABI5 and SBE2.2 genes during sugar signaling. The Plant Journal. 59: 359–374.

 

Finkelstein, R., Wang, M., Lynch, T., Rao, S., Goodman, H. 1998. The Arabidopsis abscisic acid response locus ABI4 encodes an APETALA 2 domain protein. Plant Cell. 10: 1043–1054.

 

Koussevitzky, S., Nott, A., Mockler, T., Hong, F., Sachetto-Martins, G., Surpin, M., Lim, J., Mittler, R., Chory, J. 2007. Signals from chloroplasts converge to regulate nuclear gene expression. Science. 316: 715–719.

 

Penfield, S., Li, Y., Gilday, A., Graham, S. Graham, I. 2006. Arabidopsis ABA INSENSITIVE4 regulates lipid mobilization in the embryo and reveals repression of seed germination by the endosperm. Plant Cell. 18: 1887–1899.

 

Soderman, E., Brocard, I., Lynch, T., Finkelstein, R. 2000. Regulation and function of the Arabidopsis ABA-insensitive4 gene in seed and abscisic acid response signaling networks. Plant Physiol. 124: 1752–1765.


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