Congresos NNB-UNAM, Semana Nacional de Bioinformática NNB-2010

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Caracterización y análisis genómico de fagos que infectan cepas clínicas de Pseudomonas aeruginosa
ADRIAN CAZARES LOPEZ

Última modificación: 2010-07-26

Resumen (trabajo de investigación actual y motivos para asistir)


Este proyecto tiene como principal objetivo aislar y caracterizar bacteriófagos capaces de infectar cepas clínicas de la bacteria patógena oportunista Pseudomonas aeruginosa que representa un grave problema de salud en centros hospitalarios. Actualmente se cuenta con una colección de 71 fagos aislados de fuentes naturales y 26 fagos temperados aislados a partir de cepas clínicas de P. aeruginosa. Todos ellos han sido caracterizados en base a la morfología de placa, morfología del virion, rango de hospedero y perfil de restricción. Además, se han secuenciado ya 29 de estos fagos y el siguiente objetivo es realizar el análisis de sus genomas y así entender la relación que juegan estos fagos con la patogénesis de la bacteria y encontrar también candidatos ideales para su uso como agentes terpeuticos. 

En esta etapa del proyecto la parte bioinformática es imprescindible y es por ello que el asistir a la semana nacional de bionformática nos permititiria conocer las herramientas y programas necesarios para hacer un análisis adecuado de nuestras secuencias genomicas fágicas (predicción de ORFs, promotores, terminadores, análisis filogeneticos y anotacion de los genomas, entre otros). Asimismo, me permitiria difundir dichas herramientas y programas al grupo de trabajo y así progresar de forma más rápida con el análisis de las 29 secuencias con las que se cuenta y con las de los fagos restantes de la colección que están por ser secuenciados.

 


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