Congresos NNB-UNAM, Semana Nacional de Bioinformática NNB-2010

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Curación de Bases de datos sobre regulación transcripcional
Martin Peralta Gil

Última modificación: 2010-07-27

Resumen (trabajo de investigación actual y motivos para asistir)


Actualmente me encuentro trabajando en el Centro de Ciencias Genómicas, en el Departamento de Genómica Computacional. Soy Doctor en Ciencias Bioquímicas y trabajo como curador de las principales bases de datos sobre regulación transcripcional a nivel mundial: RegulonDB y ECOCyC. Además de curar la información relacionada con los diferentes objetos de la regulación transcripcional en Escherichia coli K12 también realizo análisis de secuencias tanto nucleotídicas como de aminoácidos: sobre secuencias genéticas, secuencias de sitios de unión a factores transcripcionales, terminadores, regiones de regulación, secuencias de proteínas, etc. Por otro lado también es importante realizar comparaciones con organismos ortólogos y por esta razón la informática es fundamental. Escheriachia coli es uno de los organismos más estudiados y la tomamos como base para el estudio de la evolución y filogenia de los microorganismos. Con el avance de la genómica al paso de los años se ha demostrado que la informática es una herramienta indispensable para el estudio y análisis  de los resultados obtenidos por tecnologías que generan información masiva: high-throughput. De tal forma que sin el uso de las herramientas bioinformáticas el aprovechamiento del conocimiento biológico sería muy limitado. Así que el uso y aplicación de estas herramientas facilita el manejo de la información para que las interpretaciones biológicas sean mejores y más eficientes. 

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