Congresos NNB-UNAM, Semana Nacional de Bioinformática NNB-2010

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Análisis bioinformático del uso de codones en primates y su impacto sobre la evolución de la interacción de hormona del crecimiento (GH) con su receptor (GHR)
Juan Antonio Castillo

Última modificación: 2010-07-26

Resumen (trabajo de investigación actual y motivos para asistir)


El proyecto se basa en analizar el uso diferencial de codones en los aminoácidos más conservados reportados como importantes para que se lleve a cabo la unión de la hormona del crecimiento (GH) con su receptor (GHR) en diferentes categorías de primates (prosimios , monos del viejo y nuevo mundo , así como grandes monos). Y observar el impacto que tiene a nivel de eficacia de la traducción el cambio de codones para un mismo aminoácido.

Dicho proyecto se beneficiara con la asistencia a esta semana de bioinformática ya que en esta podre aprender más herramientas para comprender filogenias , regulación transcripcional y estructuras de proteínas , la cual me apoyara a dar una mayor perspectiva al proyecto. Así mismo si aprendo estas herramientas podre apoyar a compañeros de mi mismo laboratorio , a los nuevos alumnos que vayan a entrar al postgrado los cuales dentro de una año desarrollaran un proyecto , así como alumnos de pregrado.


Citas


Liu JC, Makova KD, Adkins RM, Gibson S, Li WH. Episodic evolution of growth hormone in primates and emergence of the species specificity of human growth hormone receptor. Mol Biol Evol. 2001 Jun;18(6):945-53.

Yi S, Bernat B, Pál G, Kossiakoff A, Li WH. Functional promiscuity of squirrel monkey growth hormone receptor toward both primate and nonprimate growth hormones. Mol Biol Evol. 2002 Jul;19(7):1083-92.

Mikita Suyama, David Torrents, and Peer Bork (2006) PAL2NAL: robust conversion of protein sequence alignments into the corresponding codon alignments. Nucleic Acids Res. 34, W609-W612.


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