Habilidades Bioinformáticas: Introducción a Unix, R, Python y Control de Versiones con Git (Software Carpentry)

Datos generales

Código: T1-HB-1, T1-HB-2
Duración: 40 horas
Fecha: del 16 al 20 de Enero de 2017
Nivel: básico
Idioma: Español
Lugar: Aulas 1 y 2 LCG

Lista de confirmados

Profesor

Grupo 1: José Nandez de Software Carpentry Foundation

Grupo 2: Susan McClatchy de Software Carpentry Foundation

Descripción

El curso de habilidades en bioinformática es un curso básico que contempla dar una introducción al manejo de UNIX que es el sistema operativo más usado en el área de Bioinformática; llevaremos a los alumnos a incursionar en el lenguaje R para el manejo de datos y su graficación, así como la presentación de resultados; Además, haremos una introducción al lenguaje Python y al control de programas y scripts a través de versiones usando la herramienta GIT.

Objetivo del curso

Brindar las habilidades básicas para incursionar en el área de bioinformática

Audiencia

Está dirigido a personas que tienen pocos o nulos conocimientos en el área de la computación.

Requisitos

  • Es necesario traer laptop, requerimientos mínimos 8GB de RAM, 100GB de espacio libre en disco duro
  • Tener instalado un navegador, de preferencia Chrome o Firefox

Contenido

  • Shell de UNIX
  • Programación en R parte 1
  • Análisis de datos y su visualización con R
  • Reportes con R Markdown
  • Control de versiones con GIT
  • Introducción al desarrollo de scripts con Python
  • Trabajando datos biológicos con Python
  • Línea de comando con Python